食品与生物工程系成立于2009年4月2日，现有绿色食品生产与检验、食品营养与检测、药品生物技术三个专业，其中绿色食品生产与检验专业是国家示范性高等职业院校建设项目重点建设专业。
师资结构
该系拥有一支教学经验丰富、实践技能扎实，服务于企业和三农的双师型教学团队。现有教职员工43名，专任教师35名，其中教授7名（含行政），副教授16名（含行政），博士16名；北京市教学名师2名，北京市青年骨干教师1名，北京市职业院校专业带头人1名，北京市“英才计划”1人，双师型教师100％；行业理事5名。
近三年
课题：
主持国家级、省部级课题100余项。
著作、教材：
主编出版教材72部，参编20余部；其中“十二五”规划教材3部，北京市精品教材2部，北京市精品课程2门，主编国家示范性高职院校重点建设专业系列教材10本；
获奖：
教师：累计教育教学成果12项，其中国家级教育教学成果二等奖1项，全国职业院校教师信息化教学大赛三等奖1项、全国农业职业教育教学优秀成果奖3项；获省部级级科技进步奖36项，教学成果奖9项。
学生：获国家级二等奖3项，三等奖7项；全国食品行业比赛一等奖6项；北京市级一、二、三等奖48项；
论文：
各类核心期刊发表论文500余篇，其中SCI论文32余篇、EI14篇，获国家发明专利61余项。
实验实训基地：
我系拥有功能齐全、内涵丰富的校内、外实验、实训基地。
校内实训基地：包括食品安全检测中心、食品加工综合实训中心、生物实验室、果蔬标准化生产基地。包括食品安全检测中心、畜产品加工实训室生物大分子实训室、虚拟仿真实训室、环境检测实训室等22个校内实训实验场所。拥有气相色谱仪、高效液相色谱仪、气质联用仪、PCR等大型高端的仪器设备，虚拟仿真实训室实现了VR技术在教学过程中的应用，建设水平已居于同类院校前列，为全面培养学生的综合实践能力提供了有力支撑。
校外实训基地：中国农业科学院加工所、质标所、检测中心，中国检验检疫科学研究院食品所，农业部农产品质量监督检验测试中心，昌平生命科学园、大兴生物医药基地、中粮集团营养健康研究院、北京农业环境监测站，北京市水文总站，北京稻香村，北京三元食品有限公司等80余家企事业单位，可满足学生的综合实训和顶岗实习，使课堂教学与企业“零距离”对接。
在校生：21个班，496人；
生师比：14:1
专升本：15%比例的学生有机会到北京工商大学、北京农学院相关专业继续深造本科学业。
专业核心课程：《食品化学》、《食品微生物检测》、《农产品营养物质分析》、《安全食品标准与认证》、《食品中转基因成分检测》、《食品营养与配餐》、《食品营养物质分析》、《食品感官检验技术》、《生物化学》、《生物制品生产与检测》、《免疫检测技术》、《生物分离与纯化技术》、《分子生物学技术》、《基因操作技术》等。